Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acta1P68134 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acta1P68134 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acta1P68134 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acta1P68134 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acta1P68134 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acta1P68134 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acta1P68134 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acta1P68134 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acta1P68134 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acta1P68134 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acta1P68134 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acta1P68134 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acta1P68134 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acta1P68134 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acta1P68134 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acta1P68134 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acta1P68134 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acta1P68134 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acta1P68134 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acta1P68134 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acta1P68134 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acta1P68134 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acta1P68134 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acta1P68134 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acta1P68134 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta1P68134 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta1P68134 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acta1P68134 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acta1P68134 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms