Protein–RNA interactions for Protein: P63157

Barhl1, BarH-like 1 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl1P63157 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms