Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms