Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copz1P61924 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copz1P61924 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copz1P61924 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copz1P61924 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Copz1P61924 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copz1P61924 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copz1P61924 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copz1P61924 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copz1P61924 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copz1P61924 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copz1P61924 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms