Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vbp1P61759 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms