Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3b6P59708 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms