Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtdsplP58465 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms