Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NcstnP57716 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NcstnP57716 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NcstnP57716 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NcstnP57716 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NcstnP57716 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NcstnP57716 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NcstnP57716 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NcstnP57716 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NcstnP57716 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms