Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gsc2P56916 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gsc2P56916 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gsc2P56916 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gsc2P56916 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gsc2P56916 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gsc2P56916 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gsc2P56916 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gsc2P56916 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gsc2P56916 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gsc2P56916 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gsc2P56916 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gsc2P56916 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gsc2P56916 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gsc2P56916 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gsc2P56916 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gsc2P56916 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gsc2P56916 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gsc2P56916 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsc2P56916 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gsc2P56916 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsc2P56916 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsc2P56916 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsc2P56916 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsc2P56916 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gsc2P56916 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsc2P56916 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gsc2P56916 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsc2P56916 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsc2P56916 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gsc2P56916 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsc2P56916 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsc2P56916 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsc2P56916 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsc2P56916 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsc2P56916 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsc2P56916 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsc2P56916 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsc2P56916 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsc2P56916 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gsc2P56916 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gsc2P56916 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gsc2P56916 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gsc2P56916 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gsc2P56916 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gsc2P56916 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gsc2P56916 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gsc2P56916 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gsc2P56916 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gsc2P56916 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gsc2P56916 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gsc2P56916 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gsc2P56916 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gsc2P56916 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gsc2P56916 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gsc2P56916 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gsc2P56916 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gsc2P56916 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gsc2P56916 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gsc2P56916 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gsc2P56916 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gsc2P56916 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gsc2P56916 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gsc2P56916 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gsc2P56916 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gsc2P56916 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gsc2P56916 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gsc2P56916 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gsc2P56916 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gsc2P56916 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gsc2P56916 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gsc2P56916 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gsc2P56916 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gsc2P56916 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gsc2P56916 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gsc2P56916 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Gsc2P56916 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gsc2P56916 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gsc2P56916 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gsc2P56916 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gsc2P56916 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gsc2P56916 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gsc2P56916 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gsc2P56916 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gsc2P56916 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gsc2P56916 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gsc2P56916 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gsc2P56916 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gsc2P56916 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gsc2P56916 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gsc2P56916 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gsc2P56916 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gsc2P56916 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gsc2P56916 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gsc2P56916 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gsc2P56916 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gsc2P56916 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gsc2P56916 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gsc2P56916 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gsc2P56916 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms