Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms