Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sh3bp1P55194 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms