Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcd3P55096 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcd3P55096 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms