Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acod1P54987 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acod1P54987 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Acod1P54987 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acod1P54987 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Acod1P54987 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms