Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PctpP53808 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PctpP53808 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PctpP53808 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PctpP53808 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PctpP53808 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PctpP53808 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PctpP53808 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PctpP53808 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PctpP53808 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PctpP53808 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PctpP53808 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PctpP53808 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PctpP53808 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PctpP53808 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PctpP53808 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PctpP53808 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PctpP53808 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PctpP53808 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PctpP53808 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PctpP53808 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PctpP53808 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PctpP53808 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PctpP53808 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PctpP53808 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PctpP53808 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PctpP53808 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PctpP53808 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PctpP53808 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PctpP53808 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PctpP53808 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PctpP53808 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PctpP53808 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PctpP53808 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PctpP53808 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PctpP53808 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PctpP53808 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PctpP53808 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PctpP53808 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PctpP53808 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PctpP53808 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PctpP53808 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PctpP53808 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PctpP53808 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PctpP53808 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PctpP53808 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PctpP53808 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PctpP53808 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PctpP53808 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PctpP53808 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PctpP53808 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PctpP53808 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PctpP53808 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PctpP53808 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PctpP53808 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PctpP53808 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PctpP53808 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PctpP53808 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PctpP53808 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PctpP53808 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PctpP53808 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PctpP53808 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PctpP53808 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PctpP53808 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PctpP53808 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PctpP53808 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PctpP53808 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PctpP53808 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PctpP53808 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PctpP53808 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PctpP53808 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PctpP53808 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PctpP53808 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PctpP53808 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PctpP53808 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PctpP53808 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PctpP53808 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PctpP53808 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PctpP53808 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PctpP53808 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PctpP53808 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PctpP53808 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PctpP53808 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PctpP53808 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PctpP53808 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PctpP53808 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PctpP53808 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PctpP53808 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PctpP53808 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PctpP53808 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PctpP53808 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PctpP53808 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PctpP53808 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PctpP53808 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PctpP53808 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PctpP53808 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PctpP53808 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PctpP53808 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PctpP53808 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PctpP53808 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms