Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec1P51908 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms