Protein–RNA interactions for Protein: P47968

Rpia, Ribose-5-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpiaP47968 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpiaP47968 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RpiaP47968 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RpiaP47968 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpiaP47968 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpiaP47968 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpiaP47968 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RpiaP47968 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpiaP47968 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpiaP47968 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RpiaP47968 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RpiaP47968 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RpiaP47968 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RpiaP47968 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpiaP47968 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpiaP47968 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpiaP47968 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpiaP47968 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpiaP47968 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpiaP47968 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpiaP47968 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpiaP47968 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpiaP47968 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpiaP47968 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpiaP47968 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RpiaP47968 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpiaP47968 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpiaP47968 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpiaP47968 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpiaP47968 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpiaP47968 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpiaP47968 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpiaP47968 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RpiaP47968 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RpiaP47968 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RpiaP47968 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RpiaP47968 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RpiaP47968 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RpiaP47968 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RpiaP47968 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms