Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scg3P47867 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg3P47867 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg3P47867 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg3P47867 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg3P47867 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg3P47867 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg3P47867 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scg3P47867 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg3P47867 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Scg3P47867 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms