Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms