Protein–RNA interactions for Protein: P43252

Ptgir, Prostacyclin receptor, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgirP43252 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtgirP43252 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgirP43252 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgirP43252 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgirP43252 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtgirP43252 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtgirP43252 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtgirP43252 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtgirP43252 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtgirP43252 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtgirP43252 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtgirP43252 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtgirP43252 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtgirP43252 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtgirP43252 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtgirP43252 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtgirP43252 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtgirP43252 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtgirP43252 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms