Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TtlP38585 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TtlP38585 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TtlP38585 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TtlP38585 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TtlP38585 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TtlP38585 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TtlP38585 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TtlP38585 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TtlP38585 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TtlP38585 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TtlP38585 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TtlP38585 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TtlP38585 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TtlP38585 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TtlP38585 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TtlP38585 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TtlP38585 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TtlP38585 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TtlP38585 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TtlP38585 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TtlP38585 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TtlP38585 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TtlP38585 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TtlP38585 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TtlP38585 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TtlP38585 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TtlP38585 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TtlP38585 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TtlP38585 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TtlP38585 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TtlP38585 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TtlP38585 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TtlP38585 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TtlP38585 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TtlP38585 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TtlP38585 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TtlP38585 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TtlP38585 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TtlP38585 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TtlP38585 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TtlP38585 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TtlP38585 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TtlP38585 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TtlP38585 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TtlP38585 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TtlP38585 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TtlP38585 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TtlP38585 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TtlP38585 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TtlP38585 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TtlP38585 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TtlP38585 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TtlP38585 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TtlP38585 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TtlP38585 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TtlP38585 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TtlP38585 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TtlP38585 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TtlP38585 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TtlP38585 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TtlP38585 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TtlP38585 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TtlP38585 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TtlP38585 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TtlP38585 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TtlP38585 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TtlP38585 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TtlP38585 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TtlP38585 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtlP38585 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtlP38585 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtlP38585 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtlP38585 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtlP38585 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtlP38585 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtlP38585 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtlP38585 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtlP38585 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtlP38585 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TtlP38585 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtlP38585 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtlP38585 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtlP38585 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtlP38585 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtlP38585 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TtlP38585 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
TtlP38585 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TtlP38585 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TtlP38585 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TtlP38585 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TtlP38585 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TtlP38585 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TtlP38585 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TtlP38585 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TtlP38585 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TtlP38585 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TtlP38585 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TtlP38585 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TtlP38585 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms