Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TpoP35419 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TpoP35419 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TpoP35419 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TpoP35419 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TpoP35419 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TpoP35419 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TpoP35419 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TpoP35419 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TpoP35419 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TpoP35419 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TpoP35419 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TpoP35419 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TpoP35419 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TpoP35419 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TpoP35419 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TpoP35419 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TpoP35419 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TpoP35419 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TpoP35419 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TpoP35419 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TpoP35419 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TpoP35419 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TpoP35419 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TpoP35419 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TpoP35419 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TpoP35419 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TpoP35419 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TpoP35419 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TpoP35419 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TpoP35419 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TpoP35419 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TpoP35419 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TpoP35419 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TpoP35419 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TpoP35419 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TpoP35419 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TpoP35419 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TpoP35419 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TpoP35419 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TpoP35419 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TpoP35419 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TpoP35419 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TpoP35419 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TpoP35419 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TpoP35419 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TpoP35419 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TpoP35419 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TpoP35419 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TpoP35419 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TpoP35419 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TpoP35419 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TpoP35419 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TpoP35419 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TpoP35419 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TpoP35419 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TpoP35419 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TpoP35419 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TpoP35419 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TpoP35419 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TpoP35419 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TpoP35419 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TpoP35419 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TpoP35419 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TpoP35419 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TpoP35419 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TpoP35419 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TpoP35419 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TpoP35419 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TpoP35419 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TpoP35419 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TpoP35419 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TpoP35419 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TpoP35419 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TpoP35419 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TpoP35419 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TpoP35419 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TpoP35419 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TpoP35419 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TpoP35419 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TpoP35419 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TpoP35419 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TpoP35419 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TpoP35419 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TpoP35419 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TpoP35419 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TpoP35419 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TpoP35419 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TpoP35419 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TpoP35419 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TpoP35419 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TpoP35419 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TpoP35419 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TpoP35419 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TpoP35419 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TpoP35419 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TpoP35419 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TpoP35419 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TpoP35419 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TpoP35419 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms