Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms