Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Apex1P28352 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apex1P28352 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apex1P28352 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apex1P28352 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apex1P28352 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apex1P28352 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms