Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa3P28310 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa3P28310 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa3P28310 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa3P28310 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa3P28310 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa3P28310 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms