Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tap1P21958 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tap1P21958 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tap1P21958 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tap1P21958 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tap1P21958 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tap1P21958 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tap1P21958 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tap1P21958 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tap1P21958 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tap1P21958 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tap1P21958 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tap1P21958 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms