Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms