Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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