Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme1P15532 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme1P15532 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme1P15532 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme1P15532 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme1P15532 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme1P15532 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme1P15532 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme1P15532 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme1P15532 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme1P15532 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme1P15532 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme1P15532 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme1P15532 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme1P15532 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme1P15532 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme1P15532 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme1P15532 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme1P15532 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme1P15532 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme1P15532 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme1P15532 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme1P15532 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme1P15532 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme1P15532 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme1P15532 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme1P15532 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme1P15532 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme1P15532 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme1P15532 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme1P15532 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme1P15532 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme1P15532 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme1P15532 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme1P15532 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms