Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms