Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc8P09025 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc8P09025 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc8P09025 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc8P09025 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc8P09025 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc8P09025 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc8P09025 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc8P09025 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc8P09025 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc8P09025 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc8P09025 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc8P09025 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc8P09025 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc8P09025 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc8P09025 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc8P09025 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc8P09025 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxc8P09025 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxc8P09025 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms