Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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