Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtrP07309 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtrP07309 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtrP07309 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtrP07309 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtrP07309 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtrP07309 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtrP07309 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtrP07309 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtrP07309 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtrP07309 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtrP07309 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtrP07309 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtrP07309 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtrP07309 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtrP07309 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtrP07309 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtrP07309 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtrP07309 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtrP07309 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtrP07309 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtrP07309 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtrP07309 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TtrP07309 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtrP07309 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtrP07309 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtrP07309 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtrP07309 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtrP07309 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TtrP07309 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtrP07309 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtrP07309 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtrP07309 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TtrP07309 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtrP07309 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtrP07309 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtrP07309 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtrP07309 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtrP07309 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtrP07309 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtrP07309 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtrP07309 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtrP07309 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtrP07309 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtrP07309 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtrP07309 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtrP07309 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtrP07309 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtrP07309 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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TtrP07309 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtrP07309 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtrP07309 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtrP07309 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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TtrP07309 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtrP07309 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtrP07309 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TtrP07309 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtrP07309 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtrP07309 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtrP07309 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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TtrP07309 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtrP07309 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtrP07309 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtrP07309 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtrP07309 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtrP07309 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtrP07309 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtrP07309 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TtrP07309 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtrP07309 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtrP07309 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtrP07309 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtrP07309 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtrP07309 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtrP07309 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtrP07309 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtrP07309 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtrP07309 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtrP07309 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtrP07309 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtrP07309 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtrP07309 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtrP07309 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtrP07309 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtrP07309 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtrP07309 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtrP07309 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtrP07309 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtrP07309 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TtrP07309 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
TtrP07309 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtrP07309 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms