Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxa7P02830 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxa7P02830 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa7P02830 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms