Protein–RNA interactions for Protein: P01193

Pomc, Pro-opiomelanocortin, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PomcP01193 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PomcP01193 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PomcP01193 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PomcP01193 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PomcP01193 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PomcP01193 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PomcP01193 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PomcP01193 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PomcP01193 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PomcP01193 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PomcP01193 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PomcP01193 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PomcP01193 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PomcP01193 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PomcP01193 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PomcP01193 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PomcP01193 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PomcP01193 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PomcP01193 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PomcP01193 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PomcP01193 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PomcP01193 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PomcP01193 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PomcP01193 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PomcP01193 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PomcP01193 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PomcP01193 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PomcP01193 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PomcP01193 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PomcP01193 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PomcP01193 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PomcP01193 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PomcP01193 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PomcP01193 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PomcP01193 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PomcP01193 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PomcP01193 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PomcP01193 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PomcP01193 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PomcP01193 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PomcP01193 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PomcP01193 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PomcP01193 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PomcP01193 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PomcP01193 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PomcP01193 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PomcP01193 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PomcP01193 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PomcP01193 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PomcP01193 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PomcP01193 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PomcP01193 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PomcP01193 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PomcP01193 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PomcP01193 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PomcP01193 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PomcP01193 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PomcP01193 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PomcP01193 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PomcP01193 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PomcP01193 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PomcP01193 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PomcP01193 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PomcP01193 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PomcP01193 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PomcP01193 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PomcP01193 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PomcP01193 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PomcP01193 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PomcP01193 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PomcP01193 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PomcP01193 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PomcP01193 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PomcP01193 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PomcP01193 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PomcP01193 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PomcP01193 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PomcP01193 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PomcP01193 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PomcP01193 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PomcP01193 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PomcP01193 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PomcP01193 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PomcP01193 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PomcP01193 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PomcP01193 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PomcP01193 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PomcP01193 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PomcP01193 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PomcP01193 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PomcP01193 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PomcP01193 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PomcP01193 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PomcP01193 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PomcP01193 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PomcP01193 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PomcP01193 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PomcP01193 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PomcP01193 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PomcP01193 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms