Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp8O89110 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp8O89110 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Casp8O89110 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casp8O89110 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casp8O89110 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casp8O89110 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casp8O89110 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Casp8O89110 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Casp8O89110 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casp8O89110 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casp8O89110 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casp8O89110 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casp8O89110 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casp8O89110 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casp8O89110 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casp8O89110 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casp8O89110 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casp8O89110 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casp8O89110 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casp8O89110 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casp8O89110 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casp8O89110 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casp8O89110 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms