Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl20O89093 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms