Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AurkcO88445 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AurkcO88445 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AurkcO88445 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AurkcO88445 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AurkcO88445 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AurkcO88445 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AurkcO88445 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AurkcO88445 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AurkcO88445 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AurkcO88445 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AurkcO88445 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AurkcO88445 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AurkcO88445 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AurkcO88445 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AurkcO88445 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AurkcO88445 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AurkcO88445 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AurkcO88445 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AurkcO88445 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
AurkcO88445 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AurkcO88445 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
AurkcO88445 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
AurkcO88445 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
AurkcO88445 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AurkcO88445 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
AurkcO88445 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AurkcO88445 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AurkcO88445 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AurkcO88445 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AurkcO88445 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AurkcO88445 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms