Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gfi1bO70237 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gfi1bO70237 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gfi1bO70237 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gfi1bO70237 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gfi1bO70237 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gfi1bO70237 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gfi1bO70237 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gfi1bO70237 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gfi1bO70237 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gfi1bO70237 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1bO70237 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfi1bO70237 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfi1bO70237 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfi1bO70237 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfi1bO70237 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gfi1bO70237 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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