Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChkbO55229 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChkbO55229 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChkbO55229 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ChkbO55229 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ChkbO55229 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms