Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EdaO54693 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EdaO54693 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EdaO54693 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EdaO54693 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EdaO54693 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EdaO54693 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EdaO54693 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EdaO54693 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EdaO54693 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EdaO54693 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EdaO54693 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EdaO54693 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EdaO54693 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EdaO54693 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EdaO54693 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EdaO54693 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EdaO54693 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EdaO54693 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EdaO54693 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EdaO54693 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EdaO54693 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EdaO54693 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EdaO54693 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EdaO54693 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EdaO54693 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EdaO54693 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EdaO54693 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EdaO54693 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EdaO54693 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EdaO54693 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EdaO54693 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EdaO54693 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EdaO54693 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EdaO54693 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EdaO54693 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EdaO54693 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EdaO54693 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EdaO54693 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EdaO54693 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EdaO54693 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EdaO54693 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EdaO54693 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EdaO54693 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EdaO54693 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EdaO54693 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EdaO54693 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EdaO54693 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EdaO54693 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EdaO54693 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EdaO54693 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EdaO54693 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EdaO54693 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EdaO54693 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EdaO54693 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EdaO54693 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EdaO54693 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EdaO54693 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EdaO54693 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EdaO54693 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EdaO54693 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EdaO54693 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EdaO54693 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EdaO54693 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EdaO54693 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EdaO54693 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EdaO54693 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EdaO54693 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EdaO54693 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EdaO54693 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EdaO54693 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EdaO54693 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EdaO54693 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EdaO54693 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EdaO54693 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EdaO54693 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EdaO54693 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EdaO54693 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EdaO54693 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EdaO54693 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EdaO54693 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EdaO54693 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EdaO54693 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EdaO54693 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EdaO54693 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EdaO54693 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EdaO54693 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EdaO54693 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EdaO54693 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EdaO54693 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EdaO54693 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EdaO54693 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EdaO54693 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EdaO54693 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EdaO54693 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EdaO54693 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EdaO54693 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EdaO54693 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EdaO54693 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EdaO54693 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms