Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cited2O35740 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited2O35740 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited2O35740 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited2O35740 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited2O35740 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cited2O35740 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cited2O35740 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cited2O35740 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited2O35740 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited2O35740 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited2O35740 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited2O35740 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited2O35740 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Cited2O35740 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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