Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx1aO35526 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms