Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms