Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sypl1O09117 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms