Protein–RNA interactions for Protein: L7N291

Gm8857, Predicted gene 8857 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8857L7N291 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8857L7N291 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8857L7N291 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8857L7N291 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8857L7N291 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8857L7N291 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8857L7N291 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8857L7N291 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8857L7N291 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8857L7N291 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8857L7N291 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8857L7N291 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8857L7N291 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8857L7N291 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8857L7N291 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8857L7N291 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8857L7N291 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8857L7N291 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8857L7N291 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8857L7N291 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8857L7N291 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms