Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm26619-201ENSMUST00000180396 1073 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm21887J3QQ04 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms