Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
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Gm20795J3QP49 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Gm20795J3QP49 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Gm20795J3QP49 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Gm20795J3QP49 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20795J3QP49 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Gm20795J3QP49 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Gm20795J3QP49 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Gm20795J3QP49 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Gm20795J3QP49 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Gm20795J3QP49 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Gm20795J3QP49 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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