Protein–RNA interactions for Protein: J3QNV7

Gm10428, Predicted gene 10428, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10428J3QNV7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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