Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17577J3QNF7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17577J3QNF7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17577J3QNF7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17577J3QNF7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17577J3QNF7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17577J3QNF7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17577J3QNF7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17577J3QNF7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17577J3QNF7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm17577J3QNF7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Gm17577J3QNF7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Gm17577J3QNF7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm17577J3QNF7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm17577J3QNF7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gm17577J3QNF7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gm17577J3QNF7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gm17577J3QNF7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gm17577J3QNF7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gm17577J3QNF7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gm17577J3QNF7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17577J3QNF7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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