Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp616J3QN14 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp616J3QN14 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms